Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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KCNMA1Q12791 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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KCNMA1Q12791 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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