Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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KCNMA1Q12791 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KCNMA1Q12791 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
KCNMA1Q12791 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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