Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4AQ13619 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CUL4AQ13619 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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CUL4AQ13619 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CUL4AQ13619 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4AQ13619 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CUL4AQ13619 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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CUL4AQ13619 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CUL4AQ13619 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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