Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
MKRN3Q13064 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
MKRN3Q13064 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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