Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms