Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PHF12Q96QT6 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms