Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TNXAQ16473 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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TNXAQ16473 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TNXAQ16473 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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