Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTGDRQ13258 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTGDRQ13258 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTGDRQ13258 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTGDRQ13258 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms