Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP13A2Q9NQ11 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ATP13A2Q9NQ11 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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