Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERPUD1Q15011 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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