Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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