Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
COL9A2Q14055 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms