Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDE3BQ13370 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDE3BQ13370 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms