Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN3Q13064 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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