Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXC1Q12948 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXC1Q12948 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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