Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRHP20396 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRHP20396 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRHP20396 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRHP20396 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRHP20396 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRHP20396 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
TRHP20396 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms