Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
U3KQE9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
U3KQE9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
U3KQE9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
U3KQE9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
U3KQE9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
U3KQE9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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