Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETBP1Q9Y6X0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms