Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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