Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms