Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF5Q9Y2D1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms