Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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