Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNMA3Q9UL41 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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