Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXD3Q9UJU5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms