Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SFMBT1Q9UHJ3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms