Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA6Q9UF33 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms