Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MBD2Q9UBB5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms