Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms