Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP35Q9P2H5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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