Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRBP1Q9P2E9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms