Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTEL1Q9NZ71 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTEL1Q9NZ71 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms