Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT57Q9NWB7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT57Q9NWB7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms