Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARVAQ9NVD7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARVAQ9NVD7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARVAQ9NVD7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARVAQ9NVD7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PARVAQ9NVD7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARVAQ9NVD7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PARVAQ9NVD7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PARVAQ9NVD7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms