Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINM1Q9NU53 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms