Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2B1Q9NRF2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms