Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC52A3Q9NQ40 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms