Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC17Q9NP64 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC17Q9NP64 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms