Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCAS3Q9H6U6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms