Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC8Q9H0W5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms