Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPESC1Q9GZL8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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