Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms