Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM3Q9BZL3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms