Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms