Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SSBP4Q9BWG4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms