Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RUSC1Q9BVN2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RUSC1Q9BVN2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms