Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UPK3BQ9BT76 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UPK3BQ9BT76 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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