Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1Q9BT67 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms