Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TIMM29Q9BSF4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms