Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM47Q9BQJ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms