Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HINFPQ9BQA5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms